محیطی آبی است که در آن موجودات آبزی زندگی کرده و اجتماع آنها وابسته به یکدیگر بوده و محیط‌زیست آن‌ها آب است. در واقع، بوم سازگان تشکیل شده در یک پیکره آبی (مانند رودخانه، برکه، دریاچه و دریا) است. دو گونه اصلی از بوم‌سامانه ها (بوم‌سامانه آب‌های شور دریا و اقیانوس و بوم‌سامانه آب‌های شیرین رودخانه ها و..) وجود دارد. زیست بوم آبی یك واحد اكولوژیكی است كه شامل ویژگی‌های فیزیكی (مانند جریان یا سرعت و عمق)، جمعیت زیستی ستون آبی و بستر، و ویژگی‌های شیمیایی مانند جامدات محلول، اكسیژن محلول و مواد مغذی می‌شود. مؤلفه‌های جاندار و بی جان سامانه آبی با یكدیگر اندركنش داشته و بر ویژگی‌ها و حالت هر مؤلفه تاثیر می‌گذارند.